昔日濁水溪出二水隘口以後分為四條分流，由北而南依序是東螺溪、西螺溪、虎尾溪、北港溪，造至日據時代東螺溪是主流，本鄉正位在東西螺溪間的浮覆地，因是溪中之沙洲，故名「溪州」，後來才改為「溪州」。

      本鄉原為巴布薩平埔族眉裡社棲居之地，清代隸屬彰化東螺堡，民國九年，日政府實施市街庄制，便將舊眉區與下壩區合併，改稱為溪州庄，屬台中州北斗郡所轄，設庄役場於今日的溪州村，溪州之所以成為日後的鄉名，至此確立。民國十六年，林本源糖廠賣給鹽水港製糖株式會社，便直接名為「溪州製糖所 」，就是日後的「溪州糖廠」。

      台灣光復後，行政區域改庄為鄉，改庄役場為鄉公所，屬於台中縣北斗區所轄，全鄉劃分為十九村，民國五十七年大莊柯分設榮光村，全鄉增為二十村，民國六十七年南州村併入溪州村，全鄉又成為十九村。